Στην αρμοδιότητα του Τμήματος Προγραμματισμού και Τεκμηρίωσης υπάγονται:

• Συντάσσει και αναθεωρεί το Εγχειρίδιο Εσωτερικών Ελέγχων
• Καταρτίζει Ετήσιο ή Πολυετές Πρόγραμμα Εργασιών, λαμβανομένων υπόψη των στρατηγικών και επιχειρησιακών προτεραιοτήτων του Α.Π.Θ., καθώς και της αξιολόγησης των κινδύνων και των ευκαιριών του
• Σχεδιάζει πρόγραμμα εσωτερικών ελέγχων επί του συνόλου των υπηρεσιών του Α.Π.Θ
• Καταρτίζει και υποβάλλει δια του Προϊσταμένου της Διεύθυνσης στον Πρύτανη προς έγκριση εντολές για τη διενέργεια προγραμματισμένων και εκτάκτων εσωτερικών ελέγχων
• Αξιολογεί τη λειτουργία του Α.Π.Θ. βάσει των αρχών της χρηστής δημοσιονομικής διοίκησης
• Παρακολουθεί, αξιολογεί και επιβεβαιώνει τις διορθωτικές ή βελτιωτικές ενέργειες, που πραγματοποιούνται από τις υπηρεσίες του Α.Π.Θ. σε συμμόρφωση με τις προτάσεις του εσωτερικού ελέγχου
• Καταρτίζει Ετήσια Έκθεση με Γνώμη σχετικά με τη συνολική επάρκεια των δομών και συστημάτων διακυβέρνησης, τη διαχείριση κινδύνων και των δικλίδων ελέγχου σε συνολικό επίπεδο ή για μεμονωμένες διαδικασίες, λειτουργίες και οργανικές μονάδες του Πανεπιστημίου
• Αξιολογεί τις διαδικασίες σχεδιασμού και εκτέλεσης των λειτουργιών και των προγραμμάτων του Α.Π.Θ.