Το Κέντρο Βυζαντινών Ερευνών διοικείται από πενταμελές Διοικητικό Συμβούλιο, το οποίο ορίζεται για μια διετία.
Το Δ.Σ. για τη διετία 2025-2027 συγκροτήθηκε, ύστερα από απόφαση της Συγκλήτου ΑΠΘ  με αριθμό 3158/19-3-2025 (ΦΕΚ 497/τ.Υ.Ο.Δ.Δ./6-5-2025).
Η θητεία των μελών του Διοικητικού Συμβουλίου είναι διετής με ημερομηνία έναρξης την ημερομηνία δημοσίευσης του ΦΕΚ (6-5-2025).