Το Πρυτανικό Συμβούλιο του Α.Π.Θ. μεταβατικά, έως τη συγκρότηση του Συμβουλίου Διοίκησης του Ιδρύματος και την ανάληψη των καθηκόντων του, ασκεί τις αρμοδιότητες του Συμβουλίου Διοίκησης, όπως αυτές προβλέπονται στο άρθρο 14 του Ν. 4957/2022 (ΦΕΚ 141/τ.Α΄/21-7-2022), όπως ισχύει, πλην της περ. κβ) της παρ. 1 και της παρ. 3 του άρθρου 14, και όσες αρμοδιότητες προβλέπεται στον Ν. 4957/2022 ότι ασκούνται από το Συμβούλιο Διοίκησης, καθώς και κάθε άλλη αρμοδιότητα που σχετίζεται με οικονομικά, διοικητικά και διαχειριστικά θέματα του Α.Π.Θ., εφόσον αυτή δεν έχει ανατεθεί από τον νόμο σε άλλο όργανο του Ιδρύματος.

Η Γραμματεία Πρυτανικού Συμβουλίου του Α.Π.Θ. παρέχει γραμματειακή και διοικητική υποστήριξη στο συλλογικό όργανο και διαχειρίζεται όλες τις σχετικές διαδικασίες που αφορούν ιδίως:

• τη συγκέντρωση, προετοιμασία και επεξεργασία όλων των θεμάτων αρμοδιότητας του Πρυτανικού Συμβουλίου, όπως αναφέρονται παραπάνω, καθώς και όσων προβλέπονται από τον Οργανισμό και τον Εσωτερικό Κανονισμό του Α.Π.Θ., σε συνεργασία με τις αρμόδιες υπηρεσίες του Πανεπιστημίου

•την προετοιμασία των συνεδριάσεων του Πρυτανικού Συμβουλίου (κατάρτιση της ημερήσιας διάταξης κατόπιν οδηγιών του κ. Πρύτανη, αποστολή της πρόσκλησης με την ημερήσια διάταξη προς τα μέλη του Πρυτανικού Συμβουλίου, ενημέρωση των μελών για τα σχετικά με θέματα της ημερήσιας διάταξης έγγραφα, με ανάρτηση των εγγράφων αυτών σε ηλεκτρονική θυρίδα, προετοιμασία τηλεδιάσκεψης σε συνεννόηση με το ΚΗΔ, όποτε γίνεται συνεδρίαση μέσω τηλεδιάσκεψης ή με μεικτό τρόπο)

• τη σύνταξη όλων των αποφάσεων του Πρυτανικού Συμβουλίου, τη δημοσίευση και κοινοποίηση αυτών, όπου απαιτείται, καθώς και τη διοικητική διεκπεραίωσή τους

• την τήρηση των πρακτικών (σύνταξη, έλεγχος και φροντίδα για την υπογραφή και επικύρωσή τους, κοινοποίηση όπου προβλέπεται)  

• την τήρηση αρχείου πρακτικών (σε ηλεκτρονική και φυσική μορφή)

• την τήρηση αρχείου αποφάσεων (σε ηλεκτρονική και φυσική μορφή)

• την έκδοση αντιγράφων ή αποσπασμάτων πρακτικών του Πρυτανικού Συμβουλίου.